・平成16年10月に新校舎が完成しました。新校舎のコンセプトは、
（1）「心の教育の推進のため、『森』に囲まれた学校にする」
（2）「個性化教育の推進のため、特色ある教室を準備する」
（3）「人と環境に優しい学校とする」
です。
・校舎周辺には、多数の木が配され、その中心木として、管理棟正面に1本のクスノキの巨木が配置されています。大垣市のシンボルツリーでもあり、21世紀に羽ばたく大垣北高及び卒業生の心の拠りどころとなることを願っています。
・校舎の外観は砂岩貼りとして、『森』に合わせた落ち着いた色調としました。管理棟南面には時計台が設置されています。時計台は“時を刻む”学びのシンボルであり、北高と地域の結節点ともなります。
・管理棟には「コンピュータ室」2つ、「ゼミナール室」、「図書情報館」、「進路支援室」、「理科実験室」など特徴的な教室が多数あります。教室は木の感触を重視して、全面フローリングとなっており、柔らかな印象を与えます。さらに、空調設備が完備され、最高の学習環境が整えられています。

・第1コンピュータ室（41台）、第2コンピュータ室（46台）、図書情報館（10台）、教室棟踊り場（5台）を利用して、情報教育の充実を目指しています。
・1年生前期の「総合的な学習の時間」では、メディア・リテラシーの習得を目標とし、コンピュータ室での授業を展開しています。これを、2年生で履修する「情報B」に発展させています。

・全職員がネームプレートを常時身につけています。
・本校周辺の安全マップの作成、防災訓練（6月）の実施など、安全対策に配慮しています。

■国公立大学
東京大8、京都大12、名古屋大23、大阪大11、神戸大10、東北大2、東京工業大1、千葉大3、岐阜大42、名古屋工業大16、静岡大12、滋賀大6、奈良女子大5、金沢大11、横浜国立大3、三重大4、名古屋市立大3、大阪府立大12　など
■私立大学
早稲田大33、慶應義塾大15、東京理科大15、中央大25、南山大113、立命館大81、同志社大61、関西大23　など
（2008年卒業生実績）

早稲田大（基幹理工1・創造理工1・先進理工1・法1・商1）、東京理科大（理工1）、中央大（法1・理工1）、法政大（デザイン1）、学習院大（文1）、明治大（政治経済1）、南山大（経済1・総合政策1・数理情報1）、立命館大（生命科学2・理工3）、同志社大（文1・経済1）、関西学院大（法1・理工2）、関西大（社1・化学生命工1）　など