クラス編成・授業はそれぞれの選んだコース・学力・進路や目標などを参考にして、画一的でなく効果のあがる集中力養成を主目的に毎朝全生徒、全職員による読書の時間を設け実施しています。学習面では、宗教科・普通科（マスターズ・サポーター）では、英・数・国の3教科については、習熟度別クラス編成を行っています。
海外留学コースでは、アメリカ人講師による英会話・留学指導を行っています。京都大学文系特別進学コースは、予備校や塾講師経験者による授業を取り入れ、実践的な指導で難関国公立大学や有名私立大学を目指しています。寄宿舎においては、集団生活を通して折り目正しい言動・自主性を養い、基本的な生活習慣を身につけさせます。

常に四恩に報じ、十善の道義心をかため、3密(身・口・意)実践の精神を高め、自他平等のもとに、自由で独自の創造性を伸長し、人間の尊厳を重んじる生徒を育成します。

“身のこなし美しく”“口にいつもありがとう”“意（こころ）におもいやりの優しさあり”の三密実践と全国から集まった人間性豊かな仲間と生活することで、協調性と幅広い見識を養います。